Описание:

Transgenomic WAVE® System – это высокочувствительная полностью автоматизированная система для скрининга мутаций в гене исследовательского интереса, не требующая использования дорогих реактивов, нетрудозатратная и дающая простые в интерпретации результаты, обладающая высокими аналитическими и диагностическими возможностями, а также гибкая в адаптации к задачам, выполняемым в молекулярно-генетических лабораториях, и квалификации специалистов. 

Она позволяет провести предварительный скрининг фрагментов ДНК на наличие мутаций, количественно оценить фракции ДНК и отобрать нужный фрагмент с мутацией для уточнения ее природы уже методом секвенирования. Высочайшая чувствительность технологии WAVE и простота эксплуатации– это именно то, что уже многие годы позволяет успешно использовать ее в лабораториях крупнейших медицинских и научных центров по всему миру.

 

Задачи, которые решает система:

• Анализ продуктов ПЦР без дополнительной очистки 
• Поиск точечных мутаций, небольших инсерций и делеций 
• Одновременный скрининг известных и неизвестных мутаций
• Качественный и количественный анализ 
• Эффективное разделение многокомпонентных смесей (продукты мультиплексной ПЦР, гетероплазмия мтхДНК, тканевой мозаицизм, соматические мутации в опухолях) – определение мутантной ДНК в концентрации до 0,5% по отношению к ДНК дикого типа
• Исследование уровня метилирования ДНК 
• Препаративная хроматография

 

Преимущества системы:

• Высокая чувствительность, точность и воспроизводимость результатов (>98%) 
• Полная автоматизация процесса от нанесения пробы до детекции сигнала
• Программное обеспечение контроля условий проведения анализа и интерпретации результата
• Высокая скорость анализа (10-15 минут)
• Открытая система – использование реагентов любых производителей
• Применение стандартных реагентов для хроматографии
• Не требует использования флуоресцентных красителей 
• Эффективное разделение фрагментов ДНК длиной 200-1000 п.н.
• Возможность очистки высокой степени для дальнейших исследований, в том числе для секвенирования 

 

Технические характеристики

Описание	WAVE System 4500	WAVE System 4500HT	WAVE System 4500HT-HS
Производительность	Средняя	Высокая	Высокая
Детекция	УФ	УФ	УФ Флуоресценция
Разделительная колонка	ДНК Sep Нагрузка: от 0.5 нг до 2 мкг ДНК	ДНК Sep HT Нагрузка: от 0.5 нг до 4 мкг ДНК	ДНК Sep HT Нагрузка: от 0.5 нг до 4 мкг ДНК
Насос высокого давления	Система формирования градиента в области низкого давления Возможность смешения до четырех разных буферов подвижной фазы Контроль расхода буферов
Автоматический дозатор	Возможность установки до трех штативов для образцов: 3 x 96 образцов 3 x 384 образцов (дополнительная опция) Тип пробирок: ПЦР-планшеты, пробирки и стрипы объемом 0,2 мл Охлаждение образцов до 4 °C Объем вносимого образца: от 1 до 450 мкл
Термостат колонок	Диапазон установки температуры от 40 °C до 100 ºC Точность установки температуры ± 0.1 °C
Ультрафиолетовый детектор	Диапазон длины волны: от 200 до 600 нм Источник УФ: Дейтериевая лампа
Флуориметрический детектор	нет	нет	Диапазон длины волны от 200 до 900 нм Источник: 150 W Ксеноновая лампа
Компьютерная система и программное обеспечение	Обеспечивает: полную автоматизацию управления прибором  контроль температурного и градиентного режима анализа  сбор и обработку данных, количественные расчеты и выдачу отчетов  готовые приложения для метода DHPLC  дизайн новых протоколов DHPLC  связь с базами данных о ДНК в глобальной сети Интернет
Габариты (ширина х глубина х высота)	34 x 50 x 101 см	34 x 50 x 101 см	68 x 50 x 77 см
Вес	80 кг	80 кг	129 кг

 

Технология

Принцип разделения фрагментов в системе WAVE используются разделительные колонки для работы с ДНК, РНК и олигонуклеотидами. Для проведения исследований доступны три температурных режима. Выбор температурного режима будет зависеть от задачи исследования. На сегодня для системы WAVE разработано более ста приложений и протоколов работы с нуклеиновыми кислотами во всех трех режимах. 

 

 

Неденатурирующий режим (40 - 50 °C) 

• Используется для работы с двуцепочечными фрагментами. 
• Принцип разделение фрагментов: по размеру. 
• Основное преимущество: полная автоматизация и экспрессность анализа. 

Возможные приложения: 

• Экспресс-анализ (3 мин, более 400 образцов в день) 
• Контроль качества ПЦР 
• Определение количества продукта ПЦР 
• Разделение продуктов мультиплексной ПЦР – Определение длины фрагментов – AFLP, RFLP, Делеционный анализ, Анализ микросателлитной нестабильности (MSI) 
• MIRU-VNTR-типирование штаммов возбудителя туберкулеза
• Анализ двуцепочечной РНК (исследования siRNA) 
• Препаративная хроматография (очистка и коллекционирование фракций ДНК, РНК, подготовка библиотек) и др. 

 

Режим неполной денатурации (50 - 70 °C)

Принцип разделение фрагментов: 

• по размеру 
• по различию в нуклеотидной последовательности (для фрагментов с одинаковым размером) Используется для разделения фрагментов, различающихся по составу нуклеотидов. 

Возможные приложения: 

• Гетеродуплексный анализ 
• Поиск любых известных и/или новых, неизвестных мутаций 
• Скрининг врожденных и соматических мутаций (протоколы для более чем 500 генов) 
• SNP, инсерции, делеции 
• Обнаружение от 1% мутантной ДНК в общем пуле 
• Концентрация и очистка обогащенных мутацией фракций ДНК для секвенирования 
• Анализ уровня метилирования 
• Гетероплазмия мтхДНК 
• Исследование полимикробных сообществ (бактерии, грибы) и др. 

 

Режим полной денатурации (75 - 80 °C)

Принцип разделение фрагментов: 

•  по размеру 
•  по различию в нуклеотидной последовательности Используется для работы с одноцепочечной ДНК, РНК, синтетическими олигонуклеотидами. 

Возможные приложения: 

• Разделение и очистка фрагментов одноцепочечной ДНК 
• Анализ и очистка олигонуклеотидов, качественный и количественный контроль 
• Анализ после энзиматических реакций, например, биотинилирование, фосфорилирование, дефосфорилирование 
• Мультиплексный SBE анализ 
• Анализ экспрессии генов 
• SSCP 
• РНК, например: 
  • Транспортная РНК 
  • Рибосомная РНК (16S, 18S и др.)
  • Митохондриальная РНК 
  • РНК-онкомаркеры и т.д.